L’objectif de ce travail était de réaliser une cartographie des sources de pollution potentielle en lien avec les activités anthropiques dans le bassin versant de la lagune Aghien. Des enquêtes sociales auprès de 4711 ménages ont été menées sur 9 sites. Ces sites correspondent à des localités rurales et urbaines situées à proximité et en amont du bassin versant de la lagune Aghien. Les données d’enquête ont été traduites en des Systèmes d’Information Géographique et analysées. Les résultats obtenus montrent que le service de gestion des ordures ménagères est inexistant, entrainant un rejet important de ceux-ci à proximité de la lagune (56 % de la production d’ordure du bassin). La gestion des excréments humains dans les localités est essentiellement de type autonome (wc à chasse d’eau, toilettes sèches et latrines) avec des défécations dans la nature et dans la lagune relativement importantes (37 % à Akandjé). Les eaux usées domestiques (branchements anarchiques) et pluviales sont charriées depuis l’amont en zone urbaine, en passant par les affluents Djibi et Bété, pour se déverser dans la lagune Aghien. Les résultats révèlent également des rejets de près de 10% de boue de vidange dans la lagune Aghien dus à une gestion informelle du secteur. Ce travail a abouti à la répartition spatiale des sources de pollution identifiées dans le bassin versant Aghien.