L’objectif de l’étude était d’évaluer l’effet des sous-produits agricoles utilisés dans le nourrissage de Oreochromis niloticus sur la diversité et l’abondance du zooplancton des étangs d’une ferme rizipiscicole. L’étude a été réalisée à l’aide d’un dispositif constitué de quatre étangs rizipiscicoles de grossissement de O. niloticus avec trois catégories d’aliments exogènes (son de maïs (RSM), son de riz (RSR) et de sous-produits combinés (RPC)), un étang rizipiscicole témoin (RC) et d’un barrage. Les paramètres physico-chimiques de l’eau de ces structures d’élevage ont été mesurés mensuellement entre mai et novembre 2020. Le zooplancton a été collecté par filtration des échantillons d’eau. Les indices de diversité et la densité cellulaire du zooplancton dans les structures d’élevage ont été calculés. Il ressort que la faune zooplanctonique des structures d’élevage est composée de 127 taxons dominés par les Rotifères représentant 62,99 %. Les apports de son de maïs et de la combinaison de sous-produits agricoles aux poissons ont permis d’enregistrer les plus fortes densités respectives de 680,6 x 106 ind/L et 550,5 x 106 ind/L de zooplancton dans les étangs rizipiscicoles. Les taxons appartenant aux familles de Asplanchnidae et de Brachionidaes ont été les plus prédominants dans les structures d’élevage. La prolifération des taxons zooplanctoniques est inféodée à la conductivité, l’acidité, la concentration de l’oxygène dissous et des sels nutritifs de l’eau des étangs rizipiscicoles. Cette étude démontre que le son de maïs et la combinaison de sous-produits agricoles peuvent être utilisés pour optimiser l’abondance du zooplancton, proie vivante des poissons, dans les systèmes d’association riz-poisson.