La réserve naturelle de Mabi-Yaya en tant qu’aire protégée est considérée comme importante dans la séquestration de carbone en Côte d’Ivoire. La présente étude a été initiée pour contribuer à la gestion durable de la réserve de Mabi-Yaya à travers l’analyse de la structure de la végétation et l’estimation du stock de carbone le long d’une chronoséquence de forêts secondaires post-culturales. L’inventaire floristique réalisé à partir de relevés de surfaces et analysé au travers de paramètres floristiques et structuraux a permis de recenser 556 espèces dans l’ensemble du massif. Elles sont réparties en 404 genres et 99 familles. Ces travaux montrent également que les paramètres de structure, la densité et l’aire basale des peuplements augmentent avec l’âge de la forêt secondaire. Le stock de carbone de la réserve est estimé à 384,58 t/ha, correspondant à une capacité de séquestration de CO2 de 1 407,55 t/ha. Le potentiel de stockage de carbone des différents biotopes rend compte de la participation de la réserve naturelle de Mabi-Yaya à la réduction du CO2 atmosphérique dans cette région de la Côte d’Ivoire.