La lagune Ebrié et ses baies sont le siège d’une sédimentation active notamment par les métaux lourds (zinc, fer, cuivre, manganèse, mercure et cadmium). La baie d’Abouabou, qui appartient à cette lagune, n’échappe pas à ce phénomène. Plusieurs facteurs peuvent influencer la répartition de ces métaux dans les fonds lagunaires. A partir de la bathymétrie de la baie, il a été mis en évidence l’influence de celle-ci sur la répartition de ces métaux. La nouvelle carte bathymétrique réalisée a révélé un taux de comblement de la baie de l’ordre de 14 cm/an entre 1979 et 2000.