Cette étude était conduite dans l’objectif d’analyser la variabilité morphologique et méristique entre les populations de l’espèce de poisson Ctenopoma muriei des marais à proximité du lac Tanganyika. Les spécimens ont été collectés entre 2011 et 2016 à l’aide des filets maillants monofilamants des mailles variables (8 et 10 mm) et des nasses posées entre les macrophytes aquatiques à des endroits où l’eau est moins profonde. Au total, 167 spécimens ont été examinés au laboratoire de Biologie du Centre de Recherche en Hydrobiologie d’Uvira. Vingt-cinq (25) variables morphométriques ont été mesurées et treize (13) variables méristiques ont été comptées sur chaque individu de poisson. Les résultats d’analyse des composantes principales des caractéristiques morphométriques et méristiques ont montré une existence de différenciations significatives et importantes entre les différents groupes partageant d’importantes caractéristiques similaires. Ces différences étaient observées sur la longueur de la tête, la base de la nageoire anale, du pédoncule caudal, du rayon mou de la nageoire anale, la mâchoire inférieure en ce qui concerne les caractéristiques morphométriques, et en nombre du rayon mou de la nageoire dorsale, d’écailles entre la nageoire pectorale et pelvienne et en nombre d’épine au-dessus de l’échancrure de l’opercule pour les caractéristiques méristiques.