Cette étude vise à analyser la biodiversité, la structuration spatiale et les préférences écologiques des crabes d’eau douce dans la région de Kisangani (RDC). L’échantillonnage, réalisé durant 6 mois dans cinq sites, a combiné des nasses appâtées et des collectes manuelles. Les spécimens ont été identifiés morphologiquement, et la structure des communautés a été évaluée à l’aide des indices de Shannon, d’équitabilité et de similarité de Jaccard. Au total, 835 individus appartenant à 9 espèces et 5 genres ont été recensés, dominés par Acanthothelphusa congoensis (55,69 %) et Acanthothelphusa stanleyensis (22,99 %). La diversité spécifique est modérée (H’ = 1,32) avec une distribution globalement équilibrée, malgré des variations inter-sites, la Réserve de Biosphère de Yangambi étant la plus riche. Les résultats montrent une forte affinité pour les substrats boueux (73,17 %) et révèlent la coexistence d’espèces ubiquistes et spécialisées, soulignant le rôle structurant des micro-habitats et les enjeux de conservation associés.